MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 53359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014378	ATG	2	6	242227	242232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391026
5002	NC_014378	TAT	2	6	242249	242254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391026
5003	NC_014378	GTA	2	6	242373	242378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391027
5004	NC_014378	TGA	3	9	242386	242394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391027
5005	NC_014378	T	6	6	242408	242413	0 %	100 %	0 %	0 %	302391027
5006	NC_014378	GAT	2	6	242511	242516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391027
5007	NC_014378	CAG	2	6	242520	242525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391027
5008	NC_014378	ATA	2	6	242569	242574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391027
5009	NC_014378	GAT	3	9	242595	242603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391027
5010	NC_014378	AGC	2	6	242681	242686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391027
5011	NC_014378	TTC	2	6	242687	242692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391027
5012	NC_014378	AGT	2	6	242744	242749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391027
5013	NC_014378	TAT	2	6	242778	242783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391027
5014	NC_014378	AAT	2	6	242868	242873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391027
5015	NC_014378	ATA	2	6	242881	242886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391027
5016	NC_014378	CAG	2	6	242903	242908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391027
5017	NC_014378	ACT	2	6	242931	242936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391027
5018	NC_014378	CAA	3	9	242959	242967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302391027
5019	NC_014378	TGAT	2	8	243064	243071	25 %	50 %	25 %	0 %	302391027
5020	NC_014378	GAA	2	6	243085	243090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391027
5021	NC_014378	TGC	2	6	243113	243118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391027
5022	NC_014378	T	9	9	243119	243127	0 %	100 %	0 %	0 %	302391027
5023	NC_014378	AAT	2	6	243153	243158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391027
5024	NC_014378	GCTG	2	8	243184	243191	0 %	25 %	50 %	25 %	302391027
5025	NC_014378	AATT	2	8	243247	243254	50 %	50 %	0 %	0 %	302391027
5026	NC_014378	AGT	2	6	243295	243300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391028
5027	NC_014378	ATTA	2	8	243325	243332	50 %	50 %	0 %	0 %	302391028
5028	NC_014378	ATG	2	6	243353	243358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391028
5029	NC_014378	ATA	2	6	243360	243365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391028
5030	NC_014378	GCA	2	6	243367	243372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391028
5031	NC_014378	AGC	2	6	243387	243392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391028
5032	NC_014378	TTCA	2	8	243489	243496	25 %	50 %	0 %	25 %	302391028
5033	NC_014378	ATT	2	6	243548	243553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391028
5034	NC_014378	AGA	2	6	243592	243597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391028
5035	NC_014378	GAT	2	6	243629	243634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391028
5036	NC_014378	ACAG	2	8	243742	243749	50 %	0 %	25 %	25 %	302391028
5037	NC_014378	TAC	2	6	243762	243767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391028
5038	NC_014378	GAAGGT	2	12	243769	243780	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391028
5039	NC_014378	TAG	2	6	243975	243980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391028
5040	NC_014378	GAA	2	6	243992	243997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391028
5041	NC_014378	ATA	2	6	244005	244010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391028
5042	NC_014378	AAG	2	6	244062	244067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391028
5043	NC_014378	GTA	2	6	244117	244122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391028
5044	NC_014378	AGA	2	6	244151	244156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5045	NC_014378	ATT	2	6	244162	244167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5046	NC_014378	TAT	2	6	244170	244175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5047	NC_014378	TAT	2	6	244190	244195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5048	NC_014378	TTA	2	6	244196	244201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5049	NC_014378	AGA	2	6	244232	244237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5050	NC_014378	ATT	2	6	244266	244271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5051	NC_014378	GGT	2	6	244275	244280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391029
5052	NC_014378	GCA	2	6	244294	244299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5053	NC_014378	AAG	2	6	244340	244345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5054	NC_014378	ACT	2	6	244375	244380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391029
5055	NC_014378	AGA	2	6	244437	244442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5056	NC_014378	AGA	2	6	244506	244511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5057	NC_014378	TAAT	2	8	244595	244602	50 %	50 %	0 %	0 %	302391029
5058	NC_014378	GTT	2	6	244632	244637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391029
5059	NC_014378	AGC	2	6	244638	244643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5060	NC_014378	GA	3	6	244742	244747	50 %	0 %	50 %	0 %	302391029
5061	NC_014378	CTA	2	6	244748	244753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391029
5062	NC_014378	AGA	2	6	244821	244826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5063	NC_014378	CTG	2	6	244840	244845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5064	NC_014378	CGG	2	6	244896	244901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302391029
5065	NC_014378	GGT	2	6	244911	244916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391029
5066	NC_014378	CTG	2	6	244919	244924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5067	NC_014378	GAA	2	6	244953	244958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5068	NC_014378	ACTT	2	8	245014	245021	25 %	50 %	0 %	25 %	302391029
5069	NC_014378	CAGC	2	8	245034	245041	25 %	0 %	25 %	50 %	302391029
5070	NC_014378	AGC	2	6	245098	245103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5071	NC_014378	GGT	2	6	245118	245123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391029
5072	NC_014378	GCT	2	6	245137	245142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5073	NC_014378	CGG	2	6	245151	245156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302391029
5074	NC_014378	CAG	2	6	245164	245169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391029
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5076	NC_014378	AGAGA	2	10	245251	245260	60 %	0 %	40 %	0 %	302391029
5077	NC_014378	ATT	2	6	245272	245277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391029
5078	NC_014378	CAG	2	6	245313	245318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391029
5079	NC_014378	GATGGA	2	12	245325	245336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391029
5080	NC_014378	AGA	2	6	245348	245353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391029
5081	NC_014378	GGA	2	6	245390	245395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391030
5082	NC_014378	GAT	2	6	245418	245423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
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5086	NC_014378	ATT	2	6	245628	245633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391030
5087	NC_014378	ATG	2	6	245634	245639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
5088	NC_014378	GAA	2	6	245649	245654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391030
5089	NC_014378	AG	3	6	245691	245696	50 %	0 %	50 %	0 %	302391030
5090	NC_014378	TGA	3	9	245717	245725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
5091	NC_014378	ATTA	2	8	245726	245733	50 %	50 %	0 %	0 %	302391030
5092	NC_014378	AGAGA	2	10	245793	245802	60 %	0 %	40 %	0 %	302391030
5093	NC_014378	GAA	2	6	245805	245810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391030
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5096	NC_014378	A	6	6	245907	245912	100 %	0 %	0 %	0 %	302391030
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5099	NC_014378	TTG	2	6	245964	245969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391030
5100	NC_014378	CGC	2	6	245977	245982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302391030
5101	NC_014378	TGA	2	6	246005	246010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
5102	NC_014378	TGA	2	6	246038	246043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
5103	NC_014378	TTAC	2	8	246044	246051	25 %	50 %	0 %	25 %	302391030
5104	NC_014378	GGA	2	6	246098	246103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391030
5105	NC_014378	GAT	2	6	246110	246115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391030
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5107	NC_014378	GGA	2	6	246302	246307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391030
5108	NC_014378	AG	3	6	246323	246328	50 %	0 %	50 %	0 %	302391030
5109	NC_014378	GGA	2	6	246386	246391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391030
5110	NC_014378	ATT	2	6	246400	246405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391030
5111	NC_014378	GAA	2	6	246480	246485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391030
5112	NC_014378	TTA	2	6	246511	246516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391030
5113	NC_014378	GACC	2	8	246521	246528	25 %	0 %	25 %	50 %	302391030
5114	NC_014378	GAA	2	6	246540	246545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391030
5115	NC_014378	AAG	2	6	246562	246567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391030
5116	NC_014378	AAT	2	6	246597	246602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391030
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5120	NC_014378	TGAA	2	8	246767	246774	50 %	25 %	25 %	0 %	302391031
5121	NC_014378	AAG	2	6	246802	246807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391031
5122	NC_014378	AGG	2	6	246854	246859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391031
5123	NC_014378	GAG	2	6	246871	246876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391031
5124	NC_014378	GGA	2	6	246963	246968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391031
5125	NC_014378	TGA	3	9	247059	247067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391031
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5127	NC_014378	TGA	2	6	247119	247124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391031
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5133	NC_014378	AGTT	2	8	247517	247524	25 %	50 %	25 %	0 %	302391031
5134	NC_014378	TAG	2	6	247556	247561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391031
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5141	NC_014378	AGG	2	6	247868	247873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391031
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5151	NC_014378	AG	3	6	248110	248115	50 %	0 %	50 %	0 %	302391032
5152	NC_014378	AGA	2	6	248137	248142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391032
5153	NC_014378	GGA	2	6	248145	248150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391032
5154	NC_014378	TAGA	2	8	248169	248176	50 %	25 %	25 %	0 %	302391032
5155	NC_014378	GAA	2	6	248177	248182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391032
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5159	NC_014378	AGA	2	6	248283	248288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391032
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5175	NC_014378	TC	3	6	248943	248948	0 %	50 %	0 %	50 %	302391032
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5214	NC_014378	GTA	2	6	250418	250423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391035
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5222	NC_014378	AC	3	6	250835	250840	50 %	0 %	0 %	50 %	302391035
5223	NC_014378	TTTA	2	8	250849	250856	25 %	75 %	0 %	0 %	302391035
5224	NC_014378	AGA	2	6	250899	250904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391035
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5227	NC_014378	CTGTA	2	10	251047	251056	20 %	40 %	20 %	20 %	302391035
5228	NC_014378	AGATA	2	10	251133	251142	60 %	20 %	20 %	0 %	302391035
5229	NC_014378	AGTC	2	8	251213	251220	25 %	25 %	25 %	25 %	302391035
5230	NC_014378	CAG	2	6	251327	251332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391035
5231	NC_014378	CAG	2	6	251372	251377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391035
5232	NC_014378	ATT	2	6	251381	251386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391035
5233	NC_014378	CAG	2	6	251390	251395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391035
5234	NC_014378	ATA	2	6	251403	251408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391035
5235	NC_014378	TGA	2	6	251422	251427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391035
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5238	NC_014378	CTT	2	6	251510	251515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391035
5239	NC_014378	ATG	2	6	251654	251659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391036
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5241	NC_014378	TGAT	2	8	251678	251685	25 %	50 %	25 %	0 %	302391036
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5364	NC_014378	ATA	2	6	259073	259078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391042
5365	NC_014378	AGT	2	6	259081	259086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391042
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5481	NC_014378	CAA	2	6	264707	264712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302391048
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